农民工欠薪打官司的费用根据金额大小计算，不超过一万元的案件每件只需交纳50元起诉费。这符合相关法律规定，同时，您还可以考虑申请支付令，这是一种要求欠薪方支付足额工资的法律手段。
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针对农民工欠薪问题，处理方式是申请支付令或提起劳动仲裁。选择的方式应视具体情况而定，如证据是否充分、金额大小等。申请支付令在证据充分、金额明确的情况下效率较高。
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遭遇工厂欠薪，可以采取以下步骤进行维权：首先，收集欠薪证据；其次，根据欠薪金额计算涉及的法律费用；接着，向法院提交起诉状和证据；然后，等待法院受理并安排庭审；在庭审过程中，陈述事实、理由和证据；最后，等待法院的判决并执行。若欠薪金额较大，建议寻求律师的专业协助。