单位扣绩效工资是否违法，需看劳动合同约定。若扣除后低于最低工资标准，则违法。依据《劳动合同法》，绩效扣除需有合同依据，否则不合法，且可能影响员工基本生活。
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单位扣绩效需查合同。合同有约定则合法，无约定则：1.与单位沟通，要求解释扣除原因；2.若沟通无果，向劳动监察部门投诉；3.必要时，提起劳动仲裁，维护自身权益。
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处理单位扣绩效工资问题，应先查劳动合同。若合同有约定，则接受扣除；若无约定，可协商或诉讼。选择方式需根据具体情况，如合同内容、扣除金额等。