司法赔偿需按程序申请。根据《中华人民共和国国家赔偿法》，首先确认违法行为，再向相关机关提出赔偿请求。如不及时处理，可能导致赔偿权利丧失或赔偿金额减少。
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司法赔偿程序如下：
1. 确认违法行为：收集证据，证明司法机关的违法行为。
2. 提出赔偿请求：向赔偿义务机关提交书面申请，附相关证据。
3. 申请复议：如对赔偿决定不满，可向上一级机关申请复议。
4. 法院决定：复议不成，可向同级人民法院赔偿委员会申请决定。
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司法赔偿常见处理方式包括协商、复议和诉讼。选择方式时，应考虑赔偿金额、时间成本和证据充分性，选择最适合自身情况的途径。